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生物信息序列分析基礎與實戰(zhàn)培訓課程

培訓對象：生物醫(yī)學研究人員、臨床檢驗人員、生物技術(shù)企業(yè)研發(fā)人員、需要掌握高通量測序數(shù)據(jù)處理流程的初學者。
培訓目標：
1. 理解高通量測序數(shù)據(jù)的基本格式與質(zhì)量評估方法，掌握原始數(shù)據(jù)的清洗與預處理流程。
2. 掌握序列比對的核心原理與常用工具，能夠完成從測序數(shù)據(jù)到比對結(jié)果的全流程操作。
3. 了解變異檢測、基因定量等下游分析的基本方法，為后續(xù)專題學習奠定基礎。
培訓內(nèi)容介紹：
1. 高通量測序技術(shù)概述：了解二代測序與三代測序的原理差異，熟悉測序數(shù)據(jù)的產(chǎn)生過程與常見應用場景。
2. 生物信息學基礎環(huán)境：熟悉Linux操作系統(tǒng)常用命令，掌握生信軟件的安裝與環(huán)境配置方法。
3. 測序數(shù)據(jù)格式解析：深入理解FASTQ、FASTA、GFF/GTF、SAM/BAM等生物信息學標準文件格式。
4. 數(shù)據(jù)質(zhì)量控制與預處理：使用FastQC進行測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估，掌握Trimmomatic/Cutadapt進行數(shù)據(jù)清洗與去接頭。
5. 序列比對原理：理解參考基因組索引構(gòu)建、比對算法原理（BWT、哈希表）及比對結(jié)果的解讀。
6. 比對工具實戰(zhàn)：使用BWA/Bowtie2將測序reads比對到參考基因組，生成SAM文件。
7. 比對后處理：使用SAMtools進行格式轉(zhuǎn)換、排序、索引，生成壓縮的BAM文件。
8. 比對結(jié)果可視化：使用IGV加載BAM文件，直觀查看reads覆蓋度、比對質(zhì)量與變異位點。
9. 變異檢測初步：了解SNP/Indel的基本概念，使用GATK或bcftools進行基礎的變異位點識別。
10. 基因表達定量初步：了解RNA-seq數(shù)據(jù)的基本定量原理，生成基因表達計數(shù)矩陣。
11. 生信流程自動化：使用Shell腳本串聯(lián)多個分析步驟，構(gòu)建簡單的自動化分析流程。
12. 綜合實戰(zhàn)演練：以一個真實的小型測序數(shù)據(jù)集為例，完成從原始數(shù)據(jù)到比對結(jié)果的完整分析流程。

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除培訓外，同時提供相關技術(shù)咨詢與技術(shù)支持服務，有需求請發(fā)需求表到郵箱soft@info-soft.cn,或致電4007991916
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服務特點：
海量專家資源，精準匹配相關行業(yè)，相關項目專家，針對實際需求，顧問式咨詢，互動式授課，案例教學，小班授課，實際項目演示，快捷高效，省時省力省錢。

專家力量：
中國科學院軟件研究所，計算研究所高級研究人員
oracle,微軟，vmware，MSC,Ansys，candence,Altium,達索等大型公司高級工程師，項目經(jīng)理，技術(shù)支持專家
中科信軟培訓中心，資深專家或講師
大多名牌大學，碩士以上學歷，相關技術(shù)專業(yè)，理論素養(yǎng)豐富
多年實際項目經(jīng)歷，大型項目實戰(zhàn)案例，熱情，樂于技術(shù)分享
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生物信息序列分析基礎與實戰(zhàn)培訓課程